Pada tahun 1999, M Nasir mulai bekerja sebagai guru di SMP Negeri 1 Liukang Tangaya Kabupaten Pangkep, kemudian mutasi ke SMP Negeri 20 Makassar tahun 2007, dan selanjutnya mutasi sebagai kepala sekolah di SMP Negeri 7 Makassar tahun 2016 sampai sekarang.
Muhammad Nasir juga aktif sebagai instruktur dan narasumber baik tingkat kota, provinsi maupun tingkat nasional, antara lain di MGMP Kota Makassar, Forum Sekolah Penggerak, Dinas Pendidikan Kota Makassar, LPMP Provinsi Sulawesi Selatan, PPPPTK Bahasa Jakarta, Program Bermutu Direktorat Pendidikan Dasar Kemdikbud, USAID DBE3 dan USAID Prioritas.
Selain itu, ia juga sarat dengan pengalaman berorganisasi, antara lain; Ketua MKKS SMP Negeri Kota Makassar tahun 2018-2020, Ketua Forum Sekolah Penggerak Kota Makassar tahun 2021-sekarang, Wakil Ketua MKKS SMP Negeri Kota Makassar tahun 2016-2018, Ketua MGMP Bahasa Indonesia Kota Makassar tahun 2018–2016, Pengurus APKS PGRI Provinsi Sulawesi Selatan tahun 2021–2024, Pengurus Nasional Asosiasi Kepala Sekolah Indonesia tahun 2021– Sekarang, Ketua DKM Masjid Al-Muttaqin Dukuh Manggala Bukit Baruga tahun 2012– sekarang
Dr. Muhammad Nasir juga pernah meraih finalis lomba guru berprestasi tingkat nasional di Jakarta tahun 2012, dan Juara 1 kepala sekolah berprestasi tingkat Kota Makassar tahun 2018, serta kepala sekolah penggerak angkatan pertama tahun 2020.
Pada tahun 2022, ia mendapatkan kesempatan mengikuti kegiatan studi tiru pendidikan ke luar negeri oleh Pemerintah Kota Makasssar ke Jepang dan Singapura bersama dengan Bunda Paud Kota Makassar, pejabat struktural, kepala sekolah, guru, dan pegiat pendidikan.